承担国控地表水监测任务的各地市环境监测站将当月监测数据分别直报总站和区站。直报总站的监测数据，于当月20日前通过“中国环境监测总站环境监测数据平台”报送;直报区站的监测数据，通过邮箱发区站综合室，审核后于当月25日前将监测数据以EXCEL格式报送至。
报送监测数据时，若监测值低于检测限，在检测限后加“L”,检测限应该满足国家地表水Ⅰ类标准值的1/4;未监测则填写“-1”，并写明原因;如监测断面水质异常，由区站组织核查，并向总站报送核查结果。
黄河宁夏段吴忠金沙湾、银川雷台村、石嘴山陶乐及固原贺家湾水库、石嘴山沙湖、银川艾依河6个区控水质自动监测站。
河流监测五参数(水温、pH、溶解氧、电导率和浊度)、氨氮、高锰酸盐指数等。
石嘴山沙湖监测五参数(水温、pH、溶解氧、电导率和浊度)、高锰酸盐指数、氨氮、总磷、总氮、氟离子、藻类、叶绿素a等。
银川艾依河监测五参数(水温、pH、溶解氧、电导率和浊度)、高锰酸盐指数、氨氮、总磷、总氮、叶绿素a等。
固原贺家湾水库监测五参数(水温、pH、溶解氧、电导率和浊度)、高锰酸盐指数等。
执行《国家地表水自动监测站运行管理办法》，每4小时监测一次。根据自身的需求可增加至2小时一次。
中卫新墩、石嘴山麻黄沟2个水质自动站为国家事权，中央财政全额保障经费。吴忠金沙湾等6个水质自动站为自治区事权，自治区保障经费。2017年国家水质自动监测站由总站统一运维管理。积极地推进区控水质自动监测站的事权上收工作，上收后由区站委托社会环境监视测定机构开展监测工作。上收前，按照现有监测方式执行。
执行《地表水和污水监测技术及规范》(HJ/T 91-2002)，《国家地表水自动监测站运行管理办法》(总站水字〔2007〕182号)及《环境水质监测质量保证手册》(第二版)。
水质自动监测站实时自动上传监测数据，监测任务承担单位每周一中午12:00之前通过“国家水质自动监测数据传输系统”报送周报数据。
区控水质自动站周报数据由各相关环境监测站于每周一中午12:00之前报送区站综合室。
按照《关于印发全区县级以上水源地名录的通知》(宁环发〔2016〕52号)文件确定的39处饮用水水源，结合目前县级行政单位所在城镇涉及的西吉县城水源地，以及固原市中庄水库，2017年纳入全区监测范围的饮用水水源地共41处。
地级及以上城市16个水源地(包含11个在用和4个备用，以及中庄水库)：银川市南郊水源地(第二水厂、第五水厂)、东郊水源地(第三水厂)、北郊水源地(第六水厂)、南梁水源地、南部水源地、征沙水源地;石嘴山市第一、二、三、四、五水源地;吴忠市金积水源地;固原市贺家湾水库水源地、海子峡水库水源地、中庄水库;中卫市沙坡头区水源地。(备用水源地为：银川市南梁水源地、南部水源地、征沙水源地;石嘴山市第三水源地。)
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